瑞急線は６つの管区で構成されている。

・尼崎管区（代表：尼崎市駅）

　→昆陽池駅に昆陽池車庫が所在。瑞急本線の梅田～芦屋市、宝塚線の全駅を管轄。

・神戸管区（代表：三宮駅）

　→車庫を唯一持たない管区。瑞急本線の本山～長田を管轄。

・名谷管区（代表：名谷駅）

　→名谷駅に名谷車庫が所在。瑞急本線の板宿～藤江を管轄。

・西神管区（代表：西神中央駅）

　→落合駅に落合車庫が所在。板宿を除く西神線各駅を管轄。

・二見管区（代表：二見駅）

　→二見駅に二見車庫が所在。瑞急本線の八木～曽根、高砂線の全駅を管轄。

・飾磨管区（代表：姫路駅）

　→西飾磨駅に飾磨車庫が所在。瑞急本線の大塩～姫路、赤穂線の全駅を管轄。

※２０２１年１１月現在。